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연구소
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공용기기실
치의학멀티오믹스센터
1. 목표 및 비전
- 생명현상에 필수적인 DNA-RNA-단백질 발현 프로세스 전반을 아우르는 분석 시스템 구축
- 라이브러리 제작-시퀀싱-분석으로 구성되는 NGS 전 과정을 단일 기관에서 수행 가능한 높은 전문성을 갖춘 연구센터 설립
- 임상-기초 치의학 및 기타 의생명과학 분야와의 융합연구를 위한 기반 확립
- NGS기반 교육을 통해 전문성 있는 융합형 인재 양성
2. 연구 및 교육
- 기초 연구 분야: 치의학 기초 연구에 활용되는 WGS, Exome, RNASeq, 프로테오믹스 등 모든 종류의 차세대염기서열 분석 연구 수행
- 임상 연구 분야: 환자 샘플을 활용한 유전체 및 마이크로바이옴 분석 연구. 서울대학교 치과병원의 인체유래물 은행과 연계하여 샘플의 NGS정보를 2차 정보화 하여 데이터베이스 구축
- 교육 활동 분야: 학부생 대상 구강 마이크로바이옴 실습 및 학부/대학원생 대상 유전체 원리, 샘플 제작 및 분석 교육
3. 멀티오믹스 분석
멀티오믹스 분석 서비스 항목
교내 및 교외 연구자를 대상으로 차세대염기서열 시퀀싱 및 생물정보학 기반 데이터 분석 서비스를 제공
4. 참여 연구진
소속 직급 성명 연구분야 치의학대학원 조교수 김진만(센터장) 구강미생물학, 면역학 치의학대학원 조교수 박한검 단백질체학 치의학대학원 조교수 김필종 생물정보학 치의학대학원 조교수 김우진 분자유전학 5. 설비현황
장비명 용도 수량 차세대 염기서열분석기
(NextSeq 2000)대량의 유전체 정보를 빠르고 정확하게 획득, 전사체 분석 및 단일세포 RNA-Seq등 다양한 연구 분석 1 차세대 염기서열분석기
(MiSeq)대량의 유전체 정보를 빠르고 정확하게 획득, 박테리아나 바이러스 유전체 분석 1 NGS 라이브러리 정량 및 사이즈 분석장비
(Tapestation)ScreenTape를 사용하여 다양한 종류의 핵산(DNA 및 RNA)의 정량, 정성분석 가능 1 단일세포 유전자 발현분석 기기
(Chromium iX)전자동 대량 유액 기반 분획 및 라벨링 장치
Droplet 기반 microfluidics를 활용한 바코딩 장비1 시약보관냉장냉동고 냉장, 냉동 시약 보관 2 형광농도측정기 (Quantus) DNA, RNA 또는 단백질 정량 2 서버(PowerEdge R760xs) 대량의 유전체 데이터를 저장하고 빠르게 분석 5. 연구성과
- Investigation of Proteome-Tetrazine Reactivity for a Highly Selective Tetrazine Ligation in Live Cells, ACS Cent. Sci., 2025, 11, 878-889. https://doi.org/10.1021/acscentsci.5c00525
- Pathological implications of Porphyromonas gingivalis in Alzheimer’s disease and therapeutic potential of gingipain inhibitors, Oral Biol. Res., 2025, 49(2). https://doi.org/10.21851/obr.25.002
- Unraveling the dynamics of osteoblast differentiation in MC3T3-E1 cells: Transcriptomic insights into matrix mineralization and cell proliferation, Bone, 2025: https://doi.org/10.1016/j.bone.2025.117442
- Combinational regenerative inductive effect of bio-adhesive hybrid hydrogels conjugated with hiPSC-derived myofibers and its derived EVs for volumetric muscle regeneration, Bioactive materials, 2025: https://doi.org/10.1016/j.bioactmat.2024.09.013
- Engineering large-scale hiPSC-derived vessel-integrated muscle-like lattices for enhanced volumetric muscle regeneration, Trends in Biotechnology, 2024: https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2024.08.001
- Hierarchical Chitin Nanocrystal-Based 3D Printed Dual-Layer Membranes Hydrogels: A Dual Drug Delivery Nano-Platform for Periodontal Tissue Regeneration, ACS Nano, 2024: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsnano.4c05558
- Development of MDM2‐Targeting PROTAC for Advancing Bone Regeneration, Advanced Science, 2025, 12(19), 2415626. https://doi.org/10.1002/advs.202415626
- Targeting class A GPCRs for hard tissue regeneration Biomaterials, 2024, 304, 122425. https://doi.org/10.1016/j.biomaterials.2023.122425
- Long noncoding RNA MALAT1 mediates fibrous topography-driven pathologic calcification through trans-differentiation of myoblasts, Materials Today Bio, 2024, 28, 101182. DOI: 10.1016/j.mtbio.2024.101182
- Exploring the Interplay Between Senescent Osteocytes and Bone Remodeling in Young Rodents, Journal of Aging Research, 2024(1), 4213141. DOI: 10.1155/2024/4213141
- Gene-centric multi-omics integration with convolutional encoders for cancer drug response prediction.,Computers in Biology and Medicine, 2022, 151, 106192. DOI: 10.1016/j.compbiomed.2022.106192
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