업 무 연 락
수신 : 교수제위
참조 : 대학원생, 연구원
제목 : [관악 공용기기실] 관악 차세대 염기서열 분석기 (Nextseq2000) 관련 참관 교육 및 DRAGEN 세미나 안내 (Research Core Facilities : DRAGEN Seminar for Next Generation Sequencing Systems. March 7th, 14th, 2023)
| Nextseq2000을 이용한 샘플 로딩 참관 _ 3/7, 3/14 오전 교육 | |
| 1. Bulk RNA-seq 샘플 : 3월 7일(화) Bulk RNA sequencing (Bulk RNA-seq)는 생물체의 전체적인 RNA 발현 프로필을 분석하는 방법 중 하나로, 모든 세포 및 조직에서 발현되는 RNA 분자들을 측정하는 실험입니다. 이 방법은 샘플 내의 모든 세포에서 RNA를 추출하고, 측정한 RNA의 양과 세포 또는 조직의 특성 사이의 상관 관계를 연구함으로써 RNA 발현 패턴의 변화와 생물학적 특성 간의 상관 관계를 파악하는 데 사용됩니다. 2. ChIP-seq 샘플 : 3월 14일(화) ChIP-seq 기술은 특정 단백질이 결합한 DNA 서열을 식별하는 기술로, 염색질 면역침전법(Chromatin Immunoprecipitation)과 고처리 시퀀싱 기술(Sequencing)을 결합한 방법입니다. ChIP-seq를 통해, 특정 단백질이 결합한 DNA 서열, 즉 DNA 결합 단백질의 결합부위를 서열 수준으로 식별할 수 있으며, 이를 통해 유전자 조절, 염색질 구조 및 에피지네틱 수정 등을 연구하는 데 사용됩니다. |
|
| |
|
| DRAGEN 세미나 _ 3/14 오후 교육 | |
| NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템에는 신속하고 정확한2차 분석 솔루션을 제공하는 온보드 DRAGEN 소프트웨어가 있습니다. 기기에 탑재되어 있는 DRAGEN 소프트웨어는 가장 흔히 사용되는 NGS 애플리케이션을 포함하는 파이프라인을 몇 가지 선별하여 제공하며, 전문가와 비전문가가 모두 신속하게 분석을 수행하고 분석 결과를 얻을 수 있도록 사용자 친화적인 인터페이스를 갖추고 있습니다. 기기에 내장된 DRAGEN Bio-IT Platform은 다음과 같은 장점을 지니고 있습니다. • 엄선된 DRAGEN 인포매틱스(informatics) 파이프라인에 대한 액세스 제공. • 빠르면 2시간 내 분석 결과 도출 가능. • 직관적인 파이프라인 알고리즘의 사용으로 외부 인포매틱스 전문가에 대한 의존도를 낮춤. |
|
DRAGEN 세미나 장소 : 관악 캠퍼스 1층 강의실 (86동 102호)
샘플 로딩 참관 장소 : 관악 공용기기실A NGS실 (86동 208호 내)
| Time | Program | Speaker |
| Day 1 (3/7, 화) | ||
| 10:00~12:00 | Bulk RNA-seq 샘플 로딩 참관 | illumina 지수민 |
| |
||
| Day 2 (3/14, 화) | ||
| 10:00~12:00 | ChIP-seq 샘플 로딩 참관 | illumina 지수민 |
| 14:00~16:00 | DRAGEN 세미나 ▶ Introduction to DRAGEN™ on the NextSeq™ 1000/2000 |
illumina 정웅재 |
※ 세미나는 대면_비대면(Zoom)으로 진행되며, 링크주소는 따로 공지될 예정입니다.
※ 세미나 Zoom 입장 시, 이름을 실명(국문명)으로 설정해 주십시오.
※ 참관 교육은 1회에 최대인원 5명으로 각 교실에서 대표 1인 신청 가능합니다.
(선착순 배정)
▪ 치학연구소 홈페이지(Register for Training Session via https://dri.snu.ac.kr by March. 6th, 2023) (로그인 필수)
공용기기실 > 교육신청 메뉴에서 본 교육 공지내용을 확인하시고 내용 하단에 보이는 [교육신청]을 클릭해 주시기 바랍니다.
▪ 사전에 참석인원 파악이 필요하므로, 반드시 3월 6일(월)까지 신청바랍니다. (홈페이지에서 교육신청이 되지 않는 경우 담당자에게 연락주시기 바랍니다.)
2023. 2. 28.
치 학 연 구 소 장